依據修正草案，在加重刑責罰金部分，食品攙偽、假冒，或加入未允許的添加物等，將現行規定處5年以下有期徒刑，提高為7年以下有期徒刑，並得併科新台幣8,000萬元以下罰金。黑心廠商行為致危害人體健康者，處1年以上、7年以下有期徒刑，並得併科1億元以下罰金。致人於死者，處無期徒刑或7年以上有期徒刑，得併科2億元以下罰金；致重傷者，處3年以上、10年以下有期徒刑，得併1億5千萬元以下罰金。
日前外界討論此次修法是否會有「溯及既往」條款，以適用劣質豬油事件的不肖廠商強冠公司和郭烈成；對此，衛福部表示，這次修法並沒有訂定溯及既往條款，不過修法刪除「一事不二罰」的規定，因此高雄市政府對強冠公司的5千萬罰金不會撤銷，不會發生日前大統事件地方政府罰金被撤銷的情況。