國道基金是在民國83年設置，主要來自國道通行費，另有部分是政府撥款、汽燃費支應及國道服務收入。
高速公路局說，國道基金主要用在興建和養護，因興建國道經費龐大，例如去年才通車的五楊高花了800多億元，國道基金都必須靠舉債才能籌措足夠經費，目前負債已高達2300億元。
高公局表示，原本國道通行費1年收入約220億元，扣除國道維修費用後，全都用來支付借款利息，估計到126年，現有債務才能還清。
不過，去年底國道計程收費上路，在地方及民代壓力下，交通部同意橫向國道頭兩年仍暫不收費，高公局預估，國道通行費年收入會降到200億元以下。
高公局擔心，105、106年是國道基金借款還本高峰期，在國道通行費收入減少下，還款能力受到挑戰，必須再靠新的借款還債。
除了面臨還款高峰外，未來還有國道7號新建案、國道4號延伸案及桃園國際機場園區新增聯外國道計畫，估計經費1500億元。
高公局憂心，如果橫向國道未來仍不收費，現行通行費率不調整，國道基金的債台會愈築愈高，還款期可能延後的130幾年或140幾年以後，新的興建計畫不易推動。