佛洛瑞斯被控在1999年至2004年擔任總統期間，貪污530萬美元，並侵占台灣10年前捐助的1,000萬美元善款。
佛洛瑞斯一度逃往國外，薩爾瓦多政府因此對他發布通緝，並透過國際刑警組織(Interpol)協尋。
薩爾瓦多在2001年發生大地震，台灣政府提供1千萬美元協助重建，但卻遭到佛洛瑞斯侵吞。佛洛瑞斯辯稱已經將捐款轉交相關單位辦理，但卻提不出轉交的證明。
佛洛瑞斯隸屬於保守派「民族共和聯盟黨」(Nationalist Republican Alliance，ARENA)。這個政黨在薩爾瓦多執政長達20年，直到2009年變天，隸屬左派「法拉本杜馬提民族解放陣線」(Farabondo Marti National Liberation Front)的傅內斯(Mauricio Funes)當選總統。今年6月宣誓就任的薩爾瓦多新總統桑契斯(Salvador Sanchez Ceren)也是隸屬於「法拉本杜馬提民族解放陣線」。