行政院大陸委員會晚間指出，自總統馬英九上任以來，兩岸已簽署21項協議，台海和平達到65年來最穩定階段，兩岸關係已經一步一步制度化、常態化，「不會因為一個事件而受到影響」。
陸委會強調，馬總統日前也提到，兩岸關係就像一棵大樹，需要不斷灌溉才能成長茁壯；張顯耀工作疑點案是一個個案，已進入司法程序，未來政府會繼續推動兩岸關係和平穩定發展，為兩岸民眾創造更大的福祉。
中國大陸國務院台灣事務辦公室主任張志軍2日在美國訪問時，被媒體詢問陸委會前副主委張顯耀去職一事時說，希望外界不要對這個問題做不負責任，或子虛烏有的猜測。
他進一步指出，兩岸關係和平發展，符合兩岸民眾的根本利益，也符合時代潮流，「兩岸關係和平發展的勢頭，不會因個別事件而停滯」。
就張志軍的談話，陸委會作出上述回應。