經濟部表示，兩岸貨品貿易協議是由兩岸經濟合作委員會下的貨品貿易工作小組負責協商，由經濟部與陸方商務部主談，從技術層面上來看，陸委會之人事變化不會影響貨品貿易協議協商。
經濟部還說，會與相關部會秉持「以台灣為主，對人民有利」的原則，持續積極推動兩岸貨品貿易協議協商，爭取台灣業者最大利益。
此外，台灣、馬來西亞民間智庫今年3月發表雙方的經濟合作協議可行性研究，何時展開官方談判？經濟部今天表示，目前談要進行FTA談判都還「太早、不成熟」。
星洲日報報導，中國大陸駐馬來西亞大使黃惠康明確表態，中國反對大馬與台灣簽FTA。經濟部長杜紫軍回應，以台灣立場來說，與其他國家談判FTA或ECA，不需要經過對岸同意。
杜紫軍認為，對岸嘗試透過政治力影響台灣對手國，「這個是有可能的」，這也是政府一直強調需與中國保持和平、友好關係的原因，才能讓台灣拓展區域經濟整合阻力降到最低。