內政部表示，自然人憑證自推廣以來，除了可用於每年5月網路報稅，在推動電子發票成效也相當顯著。累計至今年7月，已超過399萬張發票使用自然人憑證註冊歸戶。
內政部指出，今年共有6個應用系統榮獲優良獎，包括衛福部健保署「健保網路平台」、新北市政府地政局「地政資訊網路e點通服務系統」、內政部國土測繪中心「測繪圖資申購及管理系統」、衛福部社會救助及社工司「弱勢e關懷計畫全國社會福利資源整合系統」等。
其中，「弱勢e關懷計畫全國社會福利資源整合系統」內含弱勢家庭生活扶助、生育費用補助、喪葬費用補助、房屋租金補助、馬上關懷急難救助、中低老人生活津貼、身心障礙者生活補助等15項子系統，並結合內政部戶役政、親等資料自動帶入功能等程式，2013年度已減少151萬5,871份戶籍謄本、207萬8,493份財稅清單，共計省下109萬1,470張紙，並有效節省民眾往返申辦時間。