私立德光中學校長孫碧芳表示，十二年國教立意好、具理想，但上路以來家長、學生、學校等痛苦不已；往年七月初招生就告一段落，今年從六月下旬一免放榜、特招、到現在的二免，已經八月中旬仍沒忙完。
孫碧芳質疑為何一免、特招放榜，一個在週五、一個在週六，隔天都是放假日，家長、學校或老師，有事情要連絡都找不到人。
此外，一免分發後，部分中上學校實際報到率不如預期，因學科成績好的學生都想再考特招，特招不如預期的學生，又回去參加二免，學校因此招不到過去水準的學生，而且學校必須等二免未招滿，才可再辦續招，新生班級數遲遲不能定案，根本不知如何排下學期的課，現已八月中旬，新生訓練又該怎麼辦，校長直指實在是太痛苦了。
台南一中校長張添唐私下表示，十二年國教的很多問題事前都已反映，相關單位卻很少理會；他認為，十二年國教不應該採志願序，要讓學生依自己能力直接向高中職申請第一志願，未招滿再開放二免，估計最多三免就差不多了。
孫碧芳也認為，十二年國教不需特招，但可保留特色班，特招、免試一起混合填志願即可，省時、省力，也不會不公平。
吳思華則表示，教育部將舉辦多場座談會，了解基層面對的問題，希望八月底能找出更好的方案；也期許高中職校長以積極態度面對十二年國教的挑戰，在未來三年有新的局面。