行政院大陸委員會主任委員王郁琦6月與大陸國務院台灣事務辦公室主任張志軍舉行第2次兩岸事務首長會議，雙方當時宣布同意在兩岸經濟合作衍生到區域經濟合作的部分，共同研究可行方案。
兩岸經濟合作委員會第6次例會5日落幕，不過卓士昭指出，有關共同研究參與區域經濟整合部分，並未納入這次經合會議題討論。
由於大陸海協會副會長孫亞夫昨天呼籲，兩岸應儘快共同研究兩岸經濟合作共同發展，與區域經濟合作進程相銜接的適當方式和可行途徑，擴大兩岸經濟合作有利台灣參與區域經濟合作，外界關切這次未列入經合會議程原因。
卓士昭表示，主要是因為還沒決定要在陸委會、大陸國台辦的「王張會」或經濟部、大陸商務部的「兩岸經合會」的平台討論。
卓士昭解釋，由於這個議題可能不單純只是經濟議題，因此需先釐清內容後，再決定在哪個平台討論。