海巡署中部地區巡防局年初接獲多起檢舉指稱，金門不法分子利用小三通管道非法輸入香菇，即由中巡局台中機動查緝隊、海巡署金門岸巡總隊、海巡署金門查緝隊組成專案小組偵辦，並報請台中地檢署檢察官指揮偵辦。
專案小組調查發現，大陸香菇走私入境模式是透過對岸旅行社利用小三通管道夾帶香菇輸入金門，再委託民眾攜帶到台灣。
經半年調查，金門岸巡總隊昨天會同高雄關高雄機場分關離島派出課、行政院農糧署、金門縣政府警察局金城分局、調查局福建省調查處等單位，在金城鎮一處民宅及庫房分別查獲大陸香菇171、228公斤，並逮捕游姓、邵姓男子。香菇移送海關私貨倉庫查扣。
2名男子對大陸香菇入境方式支吾其詞，或是收購或委託攜帶入境。專案小組調查，私梟將香菇委託小三通旅客從大陸福建省小三通碼頭帶到金門水頭碼頭，每公斤代價新台幣200元，由金門帶到台灣的代價為300元。
金廈泉小三通每天入境旅客約2000人次，依規定，小三通旅客只能攜帶1公斤大陸香菇入境，但只能自用；從金門帶到台灣的香菇每人1.2公斤。
大陸香菇價格較台灣低廉，雖有未經檢驗、衛生安全疑慮，但還是由金廈泉小三通源源不絕進入金門，海關在入境遊客隨身攜帶行李查獲超量大陸乾香菇或乾香菇絲，封存後准許出境後領回帶出境；岸巡單位、查緝單位也陸續查獲大批大陸香菇。