馬總統神情哀戚,除了表示將於5日起,全國下半旗3天,表達哀悼之外,也呼籲大家一起出來幫助高雄的朋友度過難關,最後馬總統連呼:天佑高雄、天佑台灣、台灣平安。
馬總統說:『(原音)這次事件雖然發生在高雄,但是它衝擊卻是每一個台灣人的心都受到了衝擊。所以江院長在跟我商量之後,宣布全國要下半旗3天,來表達全國人民的哀悼。在這次,我們也要以非常肅穆、非常哀痛、也非常不捨的心情,來悼念這些失去的寶貴的生命。在這種艱困的時期,我們希望大家發揮我們的同胞愛,一起出來幫助我們高雄的朋友們度過難關,恢復正常的生活,這是我們最大的期待。最後我希望天佑高雄、天佑台灣、台灣平安!』