行政院3月23日被反服貿抗爭群眾闖入，警方隨後驅離造成流血衝突，受傷民眾向台北地方法院提起自訴，控告行政院長江宜樺、警政署長王卓鈞、台北市警局中正一分局長方仰寧、台北市警察局長黃昇勇等人，要求「追究國家暴力」；江宜樺30日也親自出庭。
自由時報31日報導指出，自訴人律師顧立雄在庭訊結束後表示，江宜樺與其他被告的說詞有歧異，「江宜樺承認，有向黃昇勇傳達，希望在上班之前恢復行政院區的秩序。」
對此，行政院發言人孫立群31日在行政院會後記者會表示，相關報導嚴重悖離事實，如果顧立雄真如報導所言，就是散佈謠言，江宜樺表達嚴重抗議，也非常遺憾。孫立群轉述說：『(原音)上面寫到，庭訊結束後，顧立雄表示，江宜樺承認有向黃昇勇傳達，希望能在上班之前恢復行政院區的秩序，講的這句話是嚴重悖離事實，顧立雄律師如果真的講的像報紙這樣登的話，那就是散佈不實謠言，院長對於這樣的行為至為遺憾，表達嚴重抗議。』
孫立群表示，案件已經進入司法程序，法官30日也特別交代是秘密庭，政院無法轉述出庭內容，但相關報導內容悖離事實。
根據了解，江宜樺3月23日當晚接到警政署長王卓鈞報告院區狀況以及台北市政府將依法驅離的決定，江宜樺表示支持這個決定，同時也提醒不要讓入侵行政院民眾闖入院長辦公室。