歷史悠久的「屏東西勢覺善堂」廟產總價逾新台幣3億元，在民國100年改選主委，但新舊任主委互控對方侵占、偽造文書對簿公堂。吳文政偵辦本案，遭民間司法改革基金會檢舉濫權，請求檢評會評鑑。
檢評會評鑑決議書指出，吳文政竟要求覺善堂新、舊派人馬在民國102年1月到警局偵查隊召開管理監察委員聯席會議，由他當會議主席，會中推選新派人馬擔任主委。
決議書指出，吳文政後來不顧仍在調查新任主委是否構成偽造文書，反而認定舊派人馬未移交印信而涉嫌侵占，竟搜索、扣押舊派人馬持有的廟方印章、13面黃金金牌、現金等廟產，將廟產發還給新派人馬保管。
吳文政辯稱，他的動機單純，當初是想徵得雙方同意，在警局依民主方式和平、理性選出主委，不但能解決主觀犯意認定的問題，也能解決地方糾紛。
但檢評會調查後認為，覺善堂即使因新舊派之爭而未選出主委，這也應透過民事訴訟、非訟事件甚至屏東縣府解決，和檢察官偵查犯罪無關。吳文政卻越俎代庖介入還代行交接，逾越檢方職權，違反法官法違失情節重大，決議報由法務部將他移送監察院，建議申誡。