中韓自由貿易協定(FTA)即將在年底完成，但兩岸相關協議仍備受各界質疑，進展緩慢，總統府國策顧問高孔廉因此建議開徵「貨貿捐」，並成立貨貿基金，指定用途扶植弱勢產業，藉以解決台灣社會對自由化的疑慮及可能拉大貧富差距的擔憂。
對此，經濟部次長杜紫軍接受媒體訪問時表示，兩岸貨貿協議的關稅優惠就是要讓進口商省錢、出口商有競爭力；若再課貨貿捐，等於抵消關稅優惠，無法提升廠商的競爭力。他說：『(原音)出口商不是賺到了那個關稅，所以你要他吐出來，他是因為對方不收關稅以後，他的競爭力增加，所以他出口，但他的收入是一樣的。比如說中國大陸減免關稅5%，我取得跟韓國一樣的公平待遇，對不對？如果你再課我3%，那我又輸給韓國啦。』
杜紫軍也指出，貨貿協議若能讓企業出口增加，企業繳的稅自然會跟著增加，若再另繳一筆貨貿捐，則形同重複課稅。
杜紫軍也強調，做生意沒有穩賺不賠，還是得依所得課稅才公平，且全世界有自由貿易相關協議的國家都沒有開徵貨貿捐的先例，若要施行，還是得先立法，依法辦理。