康照洲表示，自認全心全力投入工作，幾次遭遇食安事件，在巨大輿論和查案壓力下，與同仁日夜加班，只求在最短時間內讓案情水落石出，讓民眾免於食的恐懼；他最珍惜的是和同仁並肩作戰的革命情感，這與外人稱「長官不要他」的說法，與實情未免出入太大。
至於立委指康照牽涉一調查中的食安案件，康照洲表示，自信一切磊落，歡迎調查，並將調查結果公諸於世，還給包括他的每一位食品藥物管理署同仁清白。
康照洲強調，歷經三任署長，最先是應前衛生署長葉金川邀請，接掌藥政處處長並負籌備食品藥物管理局；楊志良接任署長，食品藥物管理局在他任內成立，兩人共事1年7個月，合作無間。
他說，邱文達接任署長後，連續爆發塑化劑、美牛瘦肉精及毒澱粉等食品事件，邱文達每天召開會議，親自指揮，才讓這些食安風波平息。
去年7月22日衛生署組織改制衛生福利部時，康照洲7月31日因為從台灣大學借調滿4年，依規定必須回學校任教，決定返校執教鞭，故於7月22日辭職；因邱文達提名而讓他獲頒行政院一等功績獎以及二等衛生獎章，公務生涯留下個美好的回憶。
立法院會臨時會日前行使監察院長、副院長同意權投票，由於遭遇杯葛，且部分監察委員被質疑不適任，立法院長王金平宣布結束臨時會，另定期處理監察院同意權案。