縣府環保局表示，行政院環保署從民國94年起在金沙鎮后江灣外、金烈水道南側及金門東側沿海設置3座監測站，監測沿海海域水質。
縣府環保局表示，歷年檢測結果顯示，金門海域各監測站水質的酸鹼值、溶氧量、氨氮、大腸桿菌群、總磷及生化需氧量等項目，都符合甲類海域水環境品質標準，另污染指標的大腸桿菌群濃度、生化需氧量都低於標準，顯示海域未受有機污染。
環保局也在今年起監測有污染潛勢的金酒公司廢水排放口及易受大陸污染的浯江溪口、金寧鄉北山、金湖鎮瓊林、金沙鎮洋山海域等5處海域水質。
環保局表示，5處海域水質第1季監測結果，重金屬砷濃度平均值每公升0.00154毫克，鎳濃度平均值每公升0.00116毫克，鋅濃度平均值每公升0.0152毫克，鉛濃度平均值低於每公升0.005毫克，鎳、總鉻、總汞都未檢出，整體海域水體都低於保護人體健康相關環境基準。