根據財政部發布自今年7月1日生效的「住家用房屋供自住及公益出租人出租使用房屋之認定標準」，個人所有的住家用房屋，必須同時符合無出租使用、供本人、配偶及直系親屬實際居住使用，以及本人、配偶及未成年子女持有戶數，全國合計在3戶以內者，才能適用1.2％的最低房屋稅稅率。
賦稅署官員說明，依照新修正的房屋稅條例規定，房屋稅徵收率係由各地方政府視在地情況，在法定稅率範圍內自行規定，除了自住房屋仍維持按1.2％稅率課稅之外，非自住之住家用房屋稅率提高為1.5％至3.6％，私人醫院、診所及專門職業事務所則提高為3％至5％。
由於台北市政府已率先宣布「房屋稅徵收自治條例」修正草案，非自住房屋將採差別稅率，在北市持有兩戶或以上，每戶稅率會加倍至2.4％、3.6％；但包括新北市在內的地方政府，仍在草案研擬階段，房屋稅徵收率均尚未出爐。
地方政府對稽徵實務面有所疑慮，例如共有房屋如何計算戶數、納稅人要選擇哪3戶房屋適用優惠稅率以及如何認定等，中央是否有實務處理辦法，應對地方政府提供具體配套措施，加以協助，以利核課，否則一到明年就面臨開徵房屋稅，那時恐怕全國都將陷入一片混亂，納稅人也會有所反彈。
地方官員建議，現行本人、配偶及未成年子女全國只限3戶的做法，課稅實務上太過複雜，有鑑於房屋稅徵收率各縣市不一，建請中央開放以縣市總歸戶的資料，在該縣市擁有第4戶以上，即課以非自住房屋的較高稅率，如此較易認定、核課。
此外，財政部下達查稅令，南區國稅局率先起跑，將針對轄區內以營利為目的之個人，購買房屋或標購法拍屋再轉手賣出的不動產交易案件，進行查稅，全台其他4區國稅局也將在近期加入查稅行列。
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