馬總統29日晚間率團展開興誼專案，前往中美洲友邦巴拿馬參加新任總統就職典禮，這是馬總統任內第10次出訪，並將順訪另一友邦薩爾瓦多。國家安全會議秘書長金溥聰上任後，首度陪同馬總統出訪。
媒體在專機上詢問，日前大陸國台辦主任張志軍來台時，警方執法有沒有過當？總統說，以他的了解，例如在桃園的諾富特飯店事件，警方並沒有破門，主要是飯店保全人員；破門的理由是因為一直不開門，且違反了相關旅館對某一個房間能有多少人進住的規定。
他表示，大家可以注意到這次警察並沒有使用拒馬，相關設施也用的比較少，政府希望警方在這方面不要如臨大敵，且警方在許多地方都做到了。
但總統說，以他的了解在高雄的部分，後來看到警方也表示歉意，實際上，陸委會很清楚地告訴大家哪些地方比較合適，「不過高雄還是決定選擇一個後來發生問題的地方」。
馬總統表示，這些抗議群眾把白漆潑到張志軍的車上時，確實為張志軍帶來一些困擾；張志軍也不理解為什麼台灣的人要用這種方式來表達意見。
總統說，他的基本看法是，台灣是民主多元的社會，集會遊行完全有自由，但絕對不能用暴力，且希望民進黨主席蔡英文面對這些帶有暴力的抗爭行動，不能迴避、不能姑息、不能鄉愿，一定要正視面對。
他表示，台灣給人的印象一向是非常正面，不要在這些屬於意見表達層次的活動上帶進暴力，「這絕對不是台灣的民主應該有的面貌」。