雙軌訓練旗艦計畫緣起金融海嘯經濟衰退時，一般全國性失業率無法反映15歲至29歲年齡層的失業率（青年失業率約為整體失業率的2至3倍）。
馬總統上午出席103年雙軌訓練旗艦計畫全國聯合畢業暨結訓典禮，他在致詞除恭喜學子能將實務訓練與學科教育一起完成，並表示希望藉雙軌訓練旗艦計畫，將15歲至29歲失業率較高的年齡層，能與全國平均失業率拉平。
馬總統說明，勞動部推出雙軌訓練旗艦計畫5年來，培育出8000多名畢業生，畢業即就業率高達9成，能有效改善青年失業率偏高，創造學生、學校與企業都三贏的局面，讓學生找到就業機會，企業能找到合適人才，學校也完成教育使命。
談及十二年國教，馬總統指出，這次一免入學完成後，高職報到率也有近8、9成，這是健康的現象，代表高職水準有逐漸改善，也正逐步推動實施就讀高職者免學費。
另外在創業部分，馬總統表示，行政院的青年圓夢計畫結合11個部會計畫於3年內結合2000多家廠商，提供就業創業機會，希望讓較高的青年失業率能與全國失業率拉近。
馬總統說，學子提早探索職能性向，至少沒有失業憂慮，不會一心想大學延畢，或擔心畢業即失業，才能放心把自己打造為國家社會都需要的專才。
馬總統也勉勵學子，希望畢業即就業後，未來仍能秉持著誠懇做人認真做事，未來一定無往不利。