十二年國教免試入學分發採用志願序扣分的制度，意即第一志願得到滿分30分，第二志願扣一分，僅29分，第三志願28分，其他志願往後以此類推。學生如果志願選填不當，第一志願沒上，極有可能因為第二志願以後被扣分而一路滑落，導致「高分低就」，甚至落榜。
因此學生知道自己的的成績排序極為重要，才能判斷志願如何填。但教育部堅持「不要分分計較」，僅提供個人成績序位百分比查詢。
第一次免試入學日前放榜，有人考了5個A++高分落榜、有人怕落榜不敢把真正想念學校填第一志願，往後選填學校，但也有人算準多數人保守心態，因為「敢填」，衝進指標社區高中。
國教行動聯盟理事長王立昇指出，學生進哪個學校已經無關學習成果，志願序扣分的制度和教育部不提供充足資訊給學生選填志願，將入學制度引入「賽局困境」，填志願還要先擔心別人選什麼學校，「敢賭的學生才會贏？」。
基北區有落榜學生的家長氣憤地表示，「努力了3年考滿分，比不上一個填志願的技巧，志願序扣分加上教育部、教改團體不肯公布透明資訊，只能傻傻的賭，卻完全沒有學校念。」
對於台北市教育局說，將向教育部爭取在第二次免試提供考生查詢更細的個人序位百分比，王立昇說「無法完全解決問題」。他說，二免名額變少，如果又判斷失誤落榜，將導致學生無校可念，有志願序扣分，問題仍和一免一樣。
家長團體昨天走上街頭，呼籲教育部懸崖勒馬，在第二次免試超額比序時，取消志願序扣分制度，讓學子依努力結果，無負擔的自由選擇想上的高中。