台灣的日本腦炎主要病媒蚊為三斑家蚊及環蚊家蚊，豬隻為主要增幅動物，病媒蚊喜歡孶生於水田、灌溉溝渠、池塘、草地積水、大型容器等，吸血高峰期為黃昏與黎明時分。日本腦炎是經由被帶病毒的病媒蚊叮咬而感染，潛伏期為5至15天，大部分為無症狀感染，少部分輕微病例會產生頭痛、發燒或無菌性腦膜炎等症狀，嚴重者則出現頭痛、高燒、昏迷、痙攣等症狀，嚴重者可能導致精神、神經性後遺症或死亡。
高雄市政府衛生局再次呼籲，疫苗接種是預防日本腦炎最有效的方法，請市民朋友依規定時程讓家中幼兒接種日本腦炎疫苗。家中應裝設紗窗、紗門，睡覺時最好使用蚊帳，避免蚊蟲叮咬。避免在黎明和黃昏等病媒蚊活動的高峰期，於豬舍、其他動物畜舍或病媒蚊孳生地點的附近活動；並宜穿著淺色的長袖衣褲，皮膚裸露處塗抹衛生福利部核可的防蚊藥劑，以降低感染的風險。
成人日本腦炎疫苗接種須知
疫苗成分及效果：
日本腦炎疫苗是一種不活化的疫苗，由感染日本腦炎病毒的新生白鼠腦部組織的懸浮液所純化製成，接種效果達百分之八十五以上，所以接種疫苗是最有效的預防方法。
疫苗接種方式：
1).接種方式為：皮下注射於上臂外側（二歲以下幼兒，建議接種於大腿前外側）。
2).成人未曾接種者：建議施打3劑，接種第1劑後，隔2週接種第2劑，隔年接種第3劑。（第2、3劑至少間隔6個月）。
3)旅遊民眾:
a.皮下注射3劑，建議時程為0，7，30天各一劑。
b.若因出國時間之限制，另一縮短的建議接種時程為0，7，14天各接種一劑。
接種禁忌：
注射日本腦炎需先經醫師看診評估，若是孕婦、感冒發燒、曾對疫苗過敏或不良反應等下列情形者，則不適合接種。
Ø 先前接種本疫苗或對本疫苗任何成分曾發生嚴重過敏反應者。
Ø 發燒或正患有急性中重度疾病者，宜待病情穩定後再接種。
Ø 其他經醫師評估不適合接種者，不予接種。
副作用：
疫苗接種後少數可能發生局部紅腫、硬塊與疼痛等反應。偶有全身反應如發燒、頭痛及倦怠感，通常二至三天內會消失，發生嚴重的反應，約百萬分之一發生機率。
幼兒日本腦炎疫苗接種
請按時帶家中出生滿十五個月的幼兒接種第一劑疫苗，間隔二週再接種第二劑疫苗，隔年還需要再接種第三劑疫苗，滿5歲時接種第四劑。完整接種四劑日本腦炎疫苗後，面對日本腦炎病毒就多了一層保護力。