海峽交流基金會副董事長兼秘書長張顯耀在本期海基會「交流」月刊中指出，反服貿運動過後，加強與國會和社會的溝通對話，讓民眾瞭解事實，是政府刻不容緩的事，也應該要讓學生多瞭解服貿協議對台灣下一代的重要性。
張顯耀說，這次學運後，政府決定擬定兩岸協議監督處理條例草案，也是回應各界意見。
目前朝野對兩岸協議監督條例也已經建立共識要積極推動，相關內容將對未來的兩岸談判及互動造成影響，至於影響如何，將視立法院最後完成三讀的版本內容而定。
他表示，一些在野人士主張兩岸協議監督條例應溯及既往，此舉可能造成兩岸航班停飛、陸客不再來台、台商投資保障權益喊卡、兩岸交流一切暫停等影響，對於兩岸關係會有相當大的衝擊。
他說，在處理兩岸協議監督條例時，應該以國家整體利益為重，回到制度面來處理，「以我過去在立法院這麼多年的經驗，也從未見到後法推翻前法，法律溯及既往的狀況」。
此外，一些在野人士主張談判人員應適用懲罰條款，最高處7年以上有期徒刑，會影響參與談判的各部會官員的意願與士氣。
在野黨提出的兩岸協議監督條例版本，將兩國論入法，等於推翻「九二共識」基礎，兩岸制度化協商會立即受到衝擊，可能無以為繼。
張顯耀指出，總統馬英九希望兩岸協議監督條例立法和服貿協議審議能夠同時並進。
政府認為，兩岸制度化協商不能停，也不能斷，更不能影響已經在進行的磋商工作，希望立法院以最快的速度完成兩岸協議監督條例立法工作，兩岸制度化協商也能同時並行。