中科四期開發案爭議多年，當地85位農民與多個政府單位在行政訴訟上相互攻防。2012年高等行政法院撤銷內政部開發許可之後，內政部不服上訴。去年最高行政法院判決指出，環保署的環評審查結論有諸多錯誤、再發回台北高等行政法院更審。
環保署11日召開環評大會，會議主席、環保署長魏國彥指出，因為開發單位科技部同意進行二階環評，再加上中科管理局承諾，在全案完成二階環評之前，不會進行新建、擴建工程，也不會申請變更，因此大會決議，中科四期全案進入二階環評。
中科四期原先規劃發展光電產業，不過在「用水」、「排水」等爭議未解的情況下，目前已經定調轉型為精密機械產業，中科管理局強調，轉型後對環境的衝擊減低，希望透過進入二階環評，跟關心環境的民眾有更好的溝通。
中科管理局副局長林威呈說：『(原音)我們轉型了以後實際上對環境的衝擊有非常大的改善，但是我們發現有些百姓的疑義，實際上他們還是不太清楚，所以在這個狀況下，我們用更公開的方式跟百姓做進一步溝通，我覺得這是永續發展的做法，但不是在擔心訴訟會失敗。我們是正向在思考這個事情。』
對此，彰化環境保護聯盟總幹事施月英表示，彰化是台灣的農業大縣，長期以來反對團體就一直憂慮中科與農民搶水、以及廢水汙染問題，希望中科四期能夠做到廢水全回收，不要汙染台灣的糧倉。