市府聲明指出，馬總統昨天到台南出席中國國民黨固本會報時表示，賴清德在擔任立委任內，宣稱兩岸若開放直航，根本是木馬屠城記；並在會中批評賴清德及市政建設，沒有根據且有失厚道。
市府指出，兩岸直航是在民主進步黨執政時開始規劃；賴清德當時為執政黨立法委員並擔任黨團幹事長，不但支持更協助推動；民進黨一向主張兩岸應溝通交流，若沒有先前的規劃與準備作業，馬總統在2008年就任後，怎麼可能在短短幾個月就啟動兩岸直航。
市府指出，馬總統所指，賴清德在擔任立委時宣稱，兩岸若開放直航是木馬屠城記的說法根據何在？應請馬總統說明白。