9類數量減少約半數
台北市動物保護處委託調查生物動向，調查人員每年五、六月在大湖公園、大佳河濱公園等開闊園地，定點記錄鳥類總數。最近一期「二○一二年度生物多樣性指標調查計畫」案，發現鳥類總數與二○○八年首次調查相較，九類數量減少約半數，包括綠繡眼、麻雀、金背鳩、紅鳩、珠頸斑鳩、小雨燕、大卷尾、八哥及斑文鳥。其中又以斑文鳥、小雨燕最嚴重。二○○八年調查指標值為一百隻，二○一二年斑文鳥剩五隻，小雨燕也只有十七隻。
報告分析，開闊與森林環境的鳥類改變發生在二○○九年之後，代表台北市的綠地、農地等非森林環境正在惡化，甚至有人為干擾，推測原因包括「舉辦花博時大面積改變公園環境」、「河濱農地環境被變更為公園綠地」，以及「劇烈氣候使得無植被保護」三大因素。
中華民國野鳥學會理事長林世忠說，鳩科鳥類容易與人類親近，紅鳩、珠頸斑鳩都是在馬路邊就可以看到的鳥類，綠繡眼、麻雀甚至與白頭翁併稱為「城市三俠」，公園常見。一旦這些鳥類有減少的狀況，代表生態亮起警訊，公園或農地的食物來源如蟲子減少，環境不適合居住時，鳥自然不會來，政府應設法改善。
北市動保處︰影響仍待觀察
動保處回應表示，在都市開發過程，土地使用的改變干擾了環境，的確讓鳥類短暫離開，也注意到鳥類減量，但花博僅是一項因素，從生態觀察來說，至少需要十年時間才能證明，有待長期的監測才能判斷都市生態是否惡化。
報告另指生活在森林環境鳥類族群呈現成長趨勢，包括竹雞與紅嘴黑鵯；濕地環境的鳥類如小白鷺、夜鷺、白腹秧雞等，則是維持穩定狀態。
林世忠說，森林環境的鳥類有增加，也代表山區保育觀念推廣出現成效，竹雞是山產常有的菜色，早期民眾會在山上隨意捕捉，近年提倡生態保育，讓民眾逐漸改掉吃山產的習慣。