馬總統30日接受日本讀賣新聞專訪，針對兩國文物互展計畫、台日關係、兩岸服貿協議、學運及台灣經貿發展等議題回應媒體提問。
總統說，中華民國與日本在1972年9月斷交後，42年來，有關釣魚台列嶼主權爭議仍持續不斷；兩年前，因日方採取國有化措施，爭議熱度提升，當時他立即提出「東海和平倡議」，希望大家以和平方式解決爭端，降低緊張，並設法擱置主權爭議，進行資源開發。
他表示，政府去年能與日方簽訂台日漁業協議，也是在這樣的情況下，並獲得國際社會普遍肯定。
馬總統說，這個協議並未解決台日雙方有關釣魚台列嶼主權爭議，而是擱置；換句話說，雙方的主張都保持現狀，但另一方面，也未讓主權爭議影響雙方在漁權方面簽訂此一協議，「主權未讓步，漁權大進步」。
他指出，在台日簽訂漁業協議的前一年，雙方在這個有台灣兩倍大的海域共發生17件爭議事件，簽訂後，從17件降為1件；雙方漁民都可到此區域捕魚，而且最近在一個常設性的漁業委員會決定下，將捕魚時間及區域分開，使雙方都可以合法運作的方式，同時達到共享資源與和平解決國際爭端目的。
台日雙方貿易量相當大，總統說，但至今雙方仍未簽訂相關貿易協定；台灣在2011年9月與日本簽訂投資協議，日本在台灣投資已有60年，過去從未制訂任何協議，簽訂後，使日本來台投資立刻增加。
此外，在參與區域經合組織議題上，總統說，台灣跟日本看法一樣，都希望加入跨太平洋夥伴協定（TPP）與區域全面經濟合作協定（RCEP），因此期盼雙方在這些領域還有可密切合作之處。
總統說，在台日未來簽訂經濟合作、經濟夥伴協定或加入TPP前，雙方仍可繼續目前進行中的各種協議，例如台灣幾年前與日本簽訂的台日電子商務合作協議與專利審查高速公路制度，這些都有助成為雙方未來進行進一步合作的基礎。