澎湖地區降雨量從民國93年的1215毫米至101年已大幅減少為921毫米，加上近年觀光產業興盛，用水量大為增加，供水缺口擴大。
行政院環境保護署今天下午召開環評大會，審查其中一案馬公第二海水淡化廠環境影響說明書。該案為了穩定供應澎湖生活用水及滿足未來觀光需求，台灣自來水公司南區工程處規劃在澎湖馬公設置出水量每天1萬噸的淡化廠，使用面積4萬9604平方公尺，分二期開發。
針對馬公觀光旺季供水問題，馬公第一海淡廠近年已在觀光旺季時配合供水，待第二海淡廠完工後，應可避免供水不足。
長期替代方案部分，開發單位自來水公司也研擬「拉大累進費率價差」水價（用水越多累進價差越大）方式，盼能落實使用者付費的公平正義。另配合水利署開徵耗水費等法源時，針對澎湖觀光用水的不合理用水量，建請水利署納入開徵耗水費範圍內，達成每人每天用水量250公升的施政目標。
此外，自來水公司規劃，馬公第二海淡廠於5年內取得環境教育設施場所認證，環教內容以節省水資源等議題為主軸。