歐巴馬今天抵達亞洲之旅的最後一站菲律賓前，兩國在馬尼拉簽署「加強國防合作協議」（EDCA），允許美方安排更多官兵到菲輪駐，共用菲國軍事基地，興建、放置軍事設施、器材、軍機與軍艦，效期10年。
一般認為，美國與菲律賓簽署這項新的軍事協議，用意是對抗中國大陸擴張在此地區的勢力。
歐巴馬與菲律賓總統艾奎諾三世（Benigno Aquino）舉行聯合記者會時表示，這項協議將促進地區安平與穩定。他又說：「我們歡迎中國和平崛起。我們與中國維持建設性的關係。」
歐巴馬推行重返亞太地區的再平衡政策，北京當局懷疑這意在圍堵中國大陸。他對此心知肚明，表態說：「我們的目標不是抗衡中國。我們的目標不是遏制中國。」
他並直接訴諸中國大陸領導人，告訴他們應該以和平方式處理海上領土糾紛，而非採取「恫嚇或脅迫」方式。
他這次亞洲行訪問的國家，都擔心因為中國崛起成為區域超級強國而受到擠壓，中國對南海與東海島礁提出的主權主張，是他與這些國家領袖會談時必談主題。
歐巴馬訪問馬尼拉時面臨一項微妙的任務，一方面要安撫因為中國大陸日益強勢而憂慮的盟國菲律賓，又要避免開罪北京的領導人，使得雙方原已緊張的關係更為惡化。
他說，美國對於這個地區引起爭端的領土究竟主權誰屬，並未採取特定立場。中國大陸、馬來西亞、日本、菲律賓、汶萊和越南等國家對於東海和南海島礁主權各有主張。
但他表示，美國作為亞太國家，在意的是維持航行自由與和平解決爭端。
歐巴馬說：「就國際法與國際規範而言，我們不認為脅迫與恫嚇是處理這些爭端的辦法。」
他也強力支持艾奎諾訴諸國際仲裁，尋求藉此解決菲律賓與中國大陸的領土爭端，包括南沙群島的仁愛礁（Second Thomas Shoal）。北京反對此作法。