訴求廢核的民眾27日下午占領忠孝西路，癱瘓交通，截至深夜，仍有1千多名民眾不願離開。由於反核團體的路權只申請到27日晚間12時，警方在28日深夜2時40分開始驅離現場民眾。
警方出動鎮暴警察、霹靂小組兵分多路，阻擋各個主要路口，同時出動噴水車，先拉離靜坐在館前路、忠孝西路口的民眾，再由鎮暴警察開始逐步往中山南路、忠孝西路口推進。
過程中，靜坐民眾不斷高喊警察後退，面對水柱則以蹲下、趴下回應，但優勢警力仍然步步進逼，雙方不斷爆發推擠。『(現場原音)警察後退！警察打人！警察不要攻擊學生，學生不是壞人。(警方：警察不會攻擊學生、等一下大家不要動手。)』
民眾在驅離過程中持續高喊「廢除核四、還權於民」。發起遊行之一的團體、綠色公民行動聯盟秘書長崔愫欣一度試圖以傳聲的方式向現場群眾喊話，希望大家回到有申請路權的凱達格蘭大道前集合，但情勢已失去控制。崔愫欣：『(原音)各位沒有辦法回到現場的朋友，我們要回到凱道集合。凱道集合！凱道集合！』
到28日清晨，台北車站前的忠孝西路路段已清空，但由於仍有近200名民眾仍靜坐在忠孝西路與中山南路口，警方抬離行動一度受阻，直到28日上午6時40左右，才將路口清空、恢復雙向通車，整個驅離過程花了整整4小時。
截至上午7時30分，現場群眾大約剩下1、200人，仍然在中山南路前靜坐抵抗，警方則將群眾往凱道方向推進。