教育部表示，這次課綱微調以不更動現行課綱各學科學分數為前提，依照社會變遷、國際脈動、教學現場需求、符合憲法等微調，並修正錯漏處等。
教育部表示，部分立委認為台灣史改了6成，主要是第四單元當代台灣（約占台灣史內容的1／4）的部分，從以往依照時間順序編排，改為分成政治、經濟、社會、文化四個主題，讓學生獲得完整歷史知識。其餘課綱主題，只是相對調整。
教育部指出，大部分調整只在於章節改變，未來教科書送審時，只需重新排列而不用改寫，因此修正幅度不會太大。
另外，教育部也重申課綱合法、合程序，依照「高級中等學校課程綱要課程審議會組成及運作辦法」運作，無論是高中分組會議或審議大會，出席委員同意微調都超過半數。
民進黨要求公開會議紀錄，教育部則強調紀錄是機關作成決定前的準備作業，涉及內部意見溝通和思辨，依照政府資訊公開法不得公開。