拓展農產加工業版圖，可同步帶動國內農產原料需求
針對部分學者認為示範區推動農業加值，將使得農產加工業者大量使用低價國外原料，進而衝擊國內農產原料一節，農委會表示，農業加值發展願景之一係「做大原有的餅」及「創造新的餅」，希望以下游產業擴張，帶動上游產業發展，讓產業鏈緊密結合，同步帶動國內農產原料使用。當日出席公聽會之臺畜公司亦表示，業者使用原料不會僅考量低價原料，產品安全性、穩定性及特殊風味才是開拓市場的關鍵因素。以該公司近期研發出台灣特色牛肉麵產品為例，使用澳洲牛肉與牛骨，高湯則以國產洋蔥與蘿蔔熬煮，再搭配雲林大埤的酸菜等，製造高附加價值的新產品，目前該項產品已通過國外客戶測試，未來量產外銷後，提高國內農產原料生產，並可共享加值利益，農企業獲利自會增聘員工，增加國內就業機會，進而活絡內需市場消費。
政府對進駐廠商類別會視產業發展加以篩選
學者憂慮國內部分敏感性農產品，將因推動農業加值遭受嚴重衝擊一節，農委會強調，世界各國在因應自由化進程時，都會同步保護國內敏感性農產業，該會於加入 WTO 時，所成立之「農產品受進口損害救助基金」意旨即在保護國內敏感性農產業，未來該基金亦可運用在加入 TPP 及 RCEP 等自由化之用途。該會進一步說明，未來示範區特別條例經立法院審查通過後，該會將據以研訂農業加值示範區事業審查原則，將會把產品是否以外銷為主、是否與國內契作、使用管制性原料是否將使國內原料被取代等因素納入審查原則，不會核准對國內有衝擊的農產業進駐示範區。另外，該會另將編列預算輔導業者與國內生產者進行契作或建立衛星農場，使業者有穩定原料來源，而生產者可有穩定收益，達到雙贏策略。
農業加值涉及野生動物保育法之疑義將廣納各界意見研議修正
另針對部分保育團體關切示範區內排除適用野生動物保育法一節，該會特別提出說明，示範區特別條例 ( 草案 ) 第 47 條所列意旨係為提升觀賞魚及週邊產業之國際競爭力，簡化觀賞水族動物輸入程序並放寬申請資格及利用限制，該項作法亦獲得出席公聽會之水族公會代表肯定，有助於觀賞魚產業整體發展。基於野生動物保育主管機關之立場，該會並未規劃放寬觀賞水族生物以外之產業範圍，惟為使未來示範區內開放對象之界定更為明確，該會定會接納外界意見，後續將與國發會共同研議修正第 47 條條文內容，將「野生動物及其產製品」明確規範為「觀賞水族動物」，以達到促進觀賞魚產業之發展目的，並兼顧保育動物、維護生物多樣性與自然生態平衡之政策目標。
面對自由化挑戰，給臺灣農業一個新的機會
農委會最後強調，臺灣已無法自外於國際間區域經濟整合潮流，未來農業亦將面對自由化挑戰，農業加值第一階段選定觀賞魚及週邊產業、動物疫苗及農漁畜產加工等高附加價值產業，在示範區內小幅度嘗試自由化措施，先扶植具發展潛力之農企業建立全球運籌模式，未來透過農企業加值 ( 工 ) 外銷之營運模式，可順利去化可能大幅進入國內市場的國外原料，避免直接衝擊國內初級農產品市場。該會也會仔細評估，謹慎調整相關作法，並在未來的雙邊或多邊談判中，持續為農業爭取最有利的條件。一方面爭取調整時間，一方面也逐步引領農業升級轉型，給臺灣農業一個新的機會 !