初審通過條文明定，中小企業投資在研究發展的支出，可選擇在支出金額15%限度內、抵減當年度營利事業所得稅額，或抵減率10%、抵減年限3年，二者擇一，並以不超過該公司當年度應納營所稅額30%為限；一經擇定，不得變更。
為因應國際經濟情勢變化，增加投資、創造就業，加強經濟成長動力並吸引外資來台，初審通過增訂，經濟景氣指數達一定情形下，新投資創立或增資擴展的中小企業，達一定投資額、增僱一定人數員工，且提高企業整體薪資給付總額時，可享有租稅抵減優惠。
初審通過條文也明定，經濟景氣指數達一定情形適用期間、投資額、增僱員工對象及人數、企業整體薪資給付總額、核定機關、申請期限、申請程序及其他相關事項，由行政院訂定。
為避免中小企業有重複獎勵情形，如果產業創新條例當中有相同性質的租稅優惠，中小企業僅能擇一適用。
此外，經委會通過附帶決議，財政部與經濟部應在修法通過後6個月內，通過相關子法，並積極宣導相關內容，嘉惠130萬家中小企業。