不過，中國大陸財新網報導，恆生電子收購案需取得大陸商務部批准，這意味著這筆收購須經過反壟斷相關審查程序，後續審批受到外界關注。
馬雲控有99.1%股權的浙江融信網路公司將買下恆生電子集團全部股權，而恆生電子集團持有恆生電子公司20.6%的股權。
報導說，雖然浙江融信與阿里巴巴集團並無股權關係，但業界擔憂阿里巴巴會透過馬雲控股恆生電子後，而掌握大陸絕大部分金融機構的後門。因為恆生電子幾乎是傳統金融機構最大的資訊軟體供應商。
據恆生電子2012年年報，公司在基金、證券、保險（放心保）、信託資訊管管領域核心市場占有率分別達到93%、80%、90%、75%，在證券帳戶系統、證券櫃台系統、銀行理財業務平台、信託核心業務平台、期貨核心系統市場占有率分別達到57%、43%、85%、41%、42%。
對於未來可能形成的市場壟斷問題，恆生電子在公告中表示，大陸金融業應用軟體及服務市場是充分競爭市場，集中度不高，且進入門檻較低，所以這次收購不會在金融應用軟體資訊服務產生限制競爭等問題。
對於市場關注金融數據一事，恒生電子公告指出，公司只是向金融機構提供金融資訊軟體，軟體交付後由客戶自行營運管理，公司不可能獲取更無可能洩露金融客戶的數據，金融數據的儲存與產權完全歸客戶控制與所有。
恆生電子公告還指出，公司開展的雲端服務業務也定位於技術平台和服務的提供，會嚴格按照和客戶的協議約定，在相關法律法規的架構下推動業務。