反台南鐵路東移自救會和學生團體下午到市府抗議，抗議群眾先在市府1樓中庭召開記者會，要求市府辦理台南鐵路地下化工程所有程序前，應先舉辦聽證會釋疑。
抗議居民人人手持菊花，要求台南市長賴清德出面溝通。居民說，攸關國家經濟的服貿都能退回，南鐵案為何不能退。
抗議居民接著直闖市府2樓市長室，市長室大門深鎖，自救會長蘇俊文氣憤地拍著市長室玻璃大門說，市長為何不願出來面對。蘇俊文再指揮眾人把自救會的三點訴求海報，貼在市長室大門上，包括「停止都市變更」、「原鐵施作不東移」及「辦聽證解爭議」。
台南市政府都市發展局長吳欣修雖代表出面解釋市府的立場和作法，但不為抗議居民接受，雙方各說各話，沒有共識，市府祕書處長蕭博仁也和抗議居民溝通，也未化解抗議居民的怒氣。
抗議居民持續在市長室門外痛批「賴清德什麼都敢做，就是不敢辦聽證會」，且把菊花擺在市長室門口，市警局派人到場監控，官民雙方僵持，抗議居民就在市長室門外逗留及發表演說，直到下午4時30分才離開，未爆發衝突。
抗議居民說，市府預定於4月7日、9日召開「都市計畫公開展覽說明會」，讓人懷疑這項會議的目的，他們一定會參加。