國民黨前發言人陳以信在媒體撰文指出，12年前翻修兩岸人民關係條例，時任陸委會主委的蔡英文原主張由行政機關自行核定，但如今卻要求審查服貿協議。
蔡英文辦公室發表聲明指出，2000年以前國民黨執政，兩岸事務的決策與管理，都由行政部門獨攬大權，民進黨執政後，由時任陸委會主委的蔡英文主導「兩岸人民關係條例」修正，並說服朝野黨團將國會監督入法，於第5條明定兩岸間任何「涉及法律修正或應以法律定之」的協議，必須送交「立法院審議」。
聲明表示，這次「兩岸人民關係條例」修正通過是在2003年10月，當時兩岸往來開放程度有限，因此對國會監督規範採低度立法，這是當時特殊背景下修法精神。
蔡英文辦公室指出，馬政府上任後，一味衝刺兩岸關係，簽署各項協議涉及人民權利及義務的重大變動，早已遠遠超過2003年修法當時的時空背景及考量因素。