菲律賓司法部18日以殺人罪起訴「廣大興28號」案的8名海巡署涉案人員，另以妨礙司法公正罪(obstruction of justice)起訴其中2名涉案人員，而殺人罪部分，菲國的法定刑期是12年至21年。
外交部長林永樂晚間舉行記者會表示，中華民國政府肯定菲律賓政府的這項決定，使得正義得以伸張；他並指出，無論是菲律賓國家調查局的報告，或是檢察總署的裁定決議書，都已經過菲國高層核定，我方希望後續司法程序可以順利進行，也會持續追蹤審理進度，林永樂說：『(原音)外交部一定持續地追蹤本案，也會全力提供家屬最大協助，這個案子我們會持之觀察後續的發展。』
法務部長羅瑩雪指出，無法預期所有過程會花費多少時間，但由於證據都已非常明確，希望法院審理程序可以迅速完成。至於引渡菲國嫌犯來台受審的問題，法務部次長陳明堂表示，因為台、菲間沒有簽署引渡協定，要引渡來台會有困難，不過屏東地院已對這8人發布通緝，一旦入境便可立即逮捕。
林永樂表示，「廣大興28號」案去年5月發生後，我方向菲方提出的道歉、賠償、懲兇以及召開漁業談判等4項要求，至此均已達成。未來中華民國政府將在既有友好關係基礎上，持續發展雙邊實質關係，並加強漁業合作，維護台灣漁民權益。