國道高速公路採取計程收費至今，仍有40萬戶未申裝eTag。由於農曆春節期間，國道取消小型車每日每車優惠里程20公里，但已有非eTag繳費用戶近日收到金額為6元的繳款通知單，若到超商補單繳費還會被收取5元手續費，讓車主大感不便民，遠通電收列印通知書及寄送成本恐怕不只6元，認為這樣的制度須要檢討。
一位江姓車主在3月7日收到2月份國道通行費用6元的繳費通知書，繳款截止日只剩一週7天，由於本身是非eTag繳費用戶，必須至超商列印單據補繳，超商將會收取代收服務費每筆5元；若想刷卡繳費，26元內免代收處理費、超過26元則須支付銀行總繳款金額1.9%的代收處理費；唯一免收手續費的方法，是親自跑一趟遠通服務中心。
江先生質疑現行制度有5大缺失，包括收到帳單日期距離繳款截止日太短，若剛好出國即會逾期；萬一沒收到以平信寄出的通知書，過了繳費期限，會被收取雙掛號通知書費用50元，甚至衍生300元的罰鍰；這筆6元的通行費若就近選擇到超商繳費，將被收取5元的手續費；政府印製寄出6元的繳款通知書，可能付出的成本更高；只寄通知書而非繳費單，繳費條碼得另外列印，更浪費紙張。
國道計程收費上路後，曾有重複扣款、App大當機等缺失，還一度爆發退租潮，也有反eTag車主集結近50人，從台北市大佳河濱公園出發，開上國道前往中壢服務區遠通電收服務站前拉布條抗議。
對此，遠通電收表示，2月中下旬之應繳通行費，若平信通知單的繳費期限遇假日，將順延到下一個工作日，即將於3月18日寄出的平信通知單就適用新制，繳費期限將自原本的3月30日週日順延至3月31日週一。
另外，為協助路人適應計次轉計程的新制度，自3月15日起，eTag及非eTag用路人皆可到全台120個遠通服務中心，由服務人員協助申請帳號密碼，登錄遠通電收網站即可查詢通行交易明細，不須再臨櫃查詢及列印。