陸委會表示，為完善港澳居民收容、強制出境制度及建置逾期停居留的裁罰等機制，該會之前擬具的港澳條例第14條、第14條之1、第47條之1修正草案，已報由行政院於民國101年6月4日函請立法院審議。現為參照司法院釋字第710號解釋意旨與「入出國及移民法」部分條文修正草案及兩岸關係條例部分條文修正草案，因此重行擬具港澳條例部分條文修正草案。
該草案修正要點如下：
一、 修正得強制港澳居民出境之法定事由，及內政部入出國及移民署（簡稱移民署）於強制經許可入境之港澳居民出境前，應賦予其陳述意見之機會；並增訂強制原已取得居留、定居許可之港澳居民出境前，應召開審查會。（修正條文第14條）
二、 增訂暫予收容、續予收容、延長收容、廢止暫予收容處分及停止收容之相關規定，並定明本次修正條文施行時，已經收容之港澳居民，如仍有繼續收容之必要，應向法院聲請續予收容或延長收容。另有關收容替代處分、得不暫予收容之事由、異議程序、法定障礙事由、暫予收容處分、收容替代處分與強制出境處分之作成方式、廢(停)止收容之程序、再暫予收容之規定、遠距審理及其他應遵行事項，準用移民法相關規定。（修正條文第14條之1）
三、 增訂逾期居留未滿30日，原申請居留原因仍繼續存在之港澳居民，經處罰後，得重新申請居留，無需強制出境之相關規定。(修正條文第14條之2)
四、 增訂移民署對於逾期停留或居留之港澳居民，得處罰鍰之規定。（修正條文第47條之1）