至於外界揣測本案若由軍事法院審理，被告會被重判。高榮志說，這是事後推論，但判決須考量法條適用等因素，不能單以刑度輕、重來論。假使軍事法庭確實重判，也可能有「替死鬼效應」小兵遭重判，恐怕又造成不公。
司改會執行長高榮志批評，洪仲丘案像空軍士兵江國慶冤死案翻版，都是由軍方上級授意、下屬聽命動手凌虐，屬於結構型犯罪。
高榮志說，本案檢方起訴時將被告論以不同法條起訴，切割因果關係分散責任，導致小兵要扛起責任，檢察官又無法以有利的證據在法庭上論告，法官依起訴事實及法條論罪，再次讓人民對司法失望。
高榮志舉例，男子張德正涉駕車衝撞總統府，雖未造成人員傷亡，但檢方仍認為他有不確定殺人故意，依殺人未遂罪嫌起訴。高榮志說，相較於洪仲丘案，司法常標準不一，讓人質疑。
桃園地院審結洪仲丘案18名被告，前542旅連長徐信正判刑8月最重；12人被判刑6月至3月不等；5人無罪，全案可上訴。輿論批評被告全獲輕判。