中科特定區計畫草案所劃設之「園道用地」將拆除現有建築物，300戶住家受影響，住戶抗議內政部這種「拆屋建綠地」的行為不合理，希望將該案撤回，市府都發局表示，已經將居民的訴求轉送至內政部審議。
市議員吳顯森於潭雅神綠園道辦理中科特定區計畫草案有關園道使用分區調整之現場會勘表示，該案將徵收潭雅神綠園道陸橋下方住戶約300多戶，但是草圖綠地保留完整，反而住宅區規劃零散，他認為應先保留現有住戶，案子撤回修正。當地居民更表示沒得到任何通知，直到最看了公告圖說，才知道家就要被拆了。
都發局表示，中科特定區計畫草案最初於98年1月23日之草案公開展覽內容時，考量公園與公共地景之塑造及增加空間綠色意象，當時即已劃設該「園道用地」，且於102年7月由內政部所召開之都市計畫委員會第807次會議審議完竣，並於102年9月23日起辦理草案再公展。針對公展期間之人民團體陳情意見，也已經於102年12月併同草案報請內政部續行審議，都發局強調，有關議員、當地里長及居民對園道用地之相關訴求，市府已送請內政部續行審議，請中央專案小組予以整體評估並檢討之。