張顯耀2012年接任行政院大陸委員會副主任委員，到陸委會後，保持低調，從不對外發言；但同時，張顯耀身段柔軟，口才靈便，不同於過去政府官員僵硬的印象，在對外政策宣導時，張顯耀的嗓門最大，場面也最熱。
張顯耀雖是主管文教的副主委，但因張顯耀過去的立法委員身分，許多國會溝通工作都由張顯耀負責、協助。兩岸服貿協議在立法院卡關後，張顯耀更常扮演「救火」的角色，時常見張顯耀在各黨籍立委與陸委會之間穿梭溝通。
此外，由於負責企劃業務，陸委會近年來大事不斷，包括「王張會」（陸委會主委王郁琦與大陸國務院台灣事務辦公室主任張志軍進行的兩岸事務機關首長會議）等，，都由張顯耀督導，「王張會」進行順利，張顯耀自然功勞不小。
曾有兩岸事務人士形容，張顯耀對業務相當熟悉，身段靈活，也有政治敏感度，表現獲得陸委會主委王郁琦賞識，這次身兼陸委會與海基會業務，「沒有三兩三，怎敢上梁山」。
今年春節後，張顯耀內定兼任海基會秘書長，將被賦予更多責任。他今天以海基會副董事長身分赴大陸召開兩岸協議檢討會議，首次表現備受關注。