在歐盟作出這項決定之前，瑞士宣布，上週的公投結果代表瑞士將無法依照原定計畫，和歐盟的新成員國克羅埃西亞簽署一份勞工市場協定。
歐盟執行委員會主席巴洛索(Jose Manuel Barroso)曾警告，這項公投將為瑞士和歐盟28國的關係，帶來「嚴重的後果」。
而立即展現的後果之一，就是歐盟執委會表示，將延後瑞士參與歐盟的800億歐元(1,090億美元)「展望2020」(Horizon 2020)研究計畫、以及147億歐元的新伊拉斯莫斯(Erasmus+)教育交流計畫。這2項計畫的範圍都涵蓋2014至2020年。
執委會發言人說，瑞士參與這2項計畫，和瑞士與克羅埃西亞之間預定的協議有著密切的關連。
發言人表示，由於瑞士和克羅埃西亞的協定尚未簽署，而且沒有明顯的政治跡象顯示會簽署，在這種情況下，在瑞士簽署協定之前，有關這2項計畫的談判都將順延。
瑞士9日舉辦公投，結果有50.3%的選民支持瑞士國會最大黨--瑞士人民黨(Swiss People's Party，SVP)提出的「反對大量移民運動」(Stop Mass Immigration)，將實施移民數量管制，限制歐盟移民到瑞士。