結束4天3夜訪問大陸南京與上海的行程後，王郁琦在記者會上表示，兩岸隔海分治65年，許多問題無法在一次的訪問中就解決，但這次的行程是一次重要的開始。他並認為，此行達到原先預設的目標，可說是圓滿順利。王郁琦：『(原音)對於這趟的訪問，我方原先設訂的目標就是要增進雙方的了解，另外也針對兩個單位間業務上的議題進行溝通，而我們確實也達到預期的目標，這次訪問行程可說是圓滿順利。』
王郁琦進一步說明，他在與張志軍會面時，就雙方關心的兩岸議題務實並坦誠交換意見，他也在會中特別向陸方強調，擱置爭議與正視現實的重要性，期盼兩岸在九二共識的基礎上，持續往前發展；雙方也同意秉持對等、尊嚴的原則，建立陸委會與國台辦的常態性聯繫溝通機制。
王郁琦表示，他是首位以現任政府官員身分登陸訪問的陸委會主委，這是兩岸關係發展歷程的重要里程碑，相信這對兩岸官方常態化互動具有指標意義。他希望在這基礎上，持續推動兩岸制度化發展，以促進台海永續和平。此外也透過後續的互訪，讓兩岸增進了解，加強互信，並期待以更坦誠的溝通，更有效率協處兩岸事務，以維護人民福祉。
王郁琦指出，這次台灣社會各界普遍肯定兩岸官方首次正式的接觸與對話，未來政府也會秉持對等跟尊嚴的立場，推動大陸政策，為維繫台海發展的繁榮而努力。