商總理事長選舉紛爭持續一個半月，在去年12月17日舉行會員代表大會選舉理監事之後，即因為到底選舉幾席理監事及當選人員名單而爆出爭議，包括法理依據、是否偽造當選名單等，已經從行政訴訟到法院按鈴申告，雙方對簿公堂。
這件紛爭已經衝擊到商總正常運作，因為爭議，張平沼說，內政部至今沒有發放當選證書給新任理事長賴正鎰，整個交接作業無法順利進行，依照相關法令，人民團體變更財務印鑑，需要三個印章，一是商總公印，這個印章已經由新任理事長賴正鎰取得，另一個是理事長印章，這個需要政府發放的當選證書，銀行才同意變更，但目前還是張平沼的印章，他無法交接。
因為爭議，商總財務無法運作，昨天上午已有部分員工以連署陳情方式向內政部提出陳情，希望內政部出面協助解決。賴正鎰指控張平沼不願意變更印鑑章，才使得員工領不到薪水，他已經決定先墊支193萬元給商總，解決員工薪水問題。
張平沼對此很氣憤，指他已經蓋過一次章，是商總要撥款給文化部的經費約500萬元，只要商總合法程序的用款，他都願意配合，而且員工薪水的事，早在一個月前他就已經明確表達願意協助蓋章發放。不過賴正鎰也透過新聞稿指出，因內政部遲遲不發出當選證書，已有部分理監事及會員代表醞釀包圍內政部、向監察院要求彈劾內政部，且向法院提告內政部瀆職，還將出面控告張平沼涉嫌背信、詐欺。
對於張平沼向江宜樺告狀的事，張平沼轉述江宜樺的說法是「如果如你所說的情況，那就是選舉無效，內政部要好好處理 」，但據了解，江宜樺到目前為止，並沒有對商總選舉做任何實質性的介入動作。