海生館的標本典藏7年，至今典藏超過3萬5000筆各式海洋生物標本，包含鯨豚、魚類、甲殼類、軟體動物等脊椎與無脊椎動物。
海生館表示，標本典藏室可分為展示室與庫房，一般民眾參訪都以展示室為主，許多標本製作的過程與存放的空間都是博物館最不為人知，但卻最引發民眾好奇的一面。
海生館說，自海洋教育中心成立以來，標本展示室就成為海生館接待外賓與參訪團體的必到處，近兩年來，已超過1萬人次參訪。
海生館將已有多年歷史的標本典藏室進行大改造，將展示的內容進行重新安排，包含7大主題區的海洋X檔案區、以台灣命名的生物區、極地區、棘皮動物區、甲殼動物區和軟體動物區與皇帶魚區。
除此之外，海生館利用開放式典藏庫房的概念讓民眾除了觀看到標本外，可以有機會一睹研究人員在進行標本製做與研究時的真實面貌與標本收藏的秘密空間。1030123