國稅局指出，扣繳義務人（如公司行號），給付居住在中華民國境內滿183天者的年終獎金若在6萬9500元以下，免扣繳所得稅，但仍應依所得稅法第89條第3項規定列單申報主管稽徵機關。
例如A公司於民國103年1月10日發放員工甲、乙兩人102年度年終工作獎金(非每月給付之薪資)，甲君領取年終工作獎金5萬元，因未達起扣標準6萬9501元，所以不會被扣繳所得稅；乙君領取年終工作獎金7萬元，達到起扣標準，應按給付額扣繳5%所得稅，即3500元。並且要在明年(104年)申報扣繳。
國稅局提醒扣繳義務人，按所得稅法第14條第1項第3類有關薪資所得計算，在職務上或工作上取得的各種薪資收入為所得額，包括薪金、工資、津貼、獎金、紅利及各種補助費等；因此，員工領取的年終工作獎金，仍屬員工在職務上或工作上所取得的薪資，應由扣繳義務人於給付時，依規定辦理扣繳。