今年元旦eTag系統發生當機事件，遠通電收對外聲稱是因為遭駭客攻擊計程收費App導致，政務委員張善政當時也稱這可列資安3級危機，非常嚴重。但據《蘋果》即時新聞今(15)日取得被行政院列為「密件」的國家資通安全會報技術服務中心調查報告指出，這並非駭客惡意攻擊，而是遠通電收的App漏洞。
該調查報告指出，遠通電收日前聲稱系統每秒受到65萬次攻擊、3.5小時內遭受到82億次攻擊，報告也澄清，「82億次」是遠通電收以1月2日凌晨4點58分的瞬間最高連線數量計算，「非每1秒鐘皆有65萬次連線」，因此，遠通計算的82億次「似乎不合常理」。
該報告也駁斥遠通「遭駭」的說法，而是當Android系統如平板電腦、手機使用者在開啟遠通電收App註冊時，會先連線到後端伺服器註冊1個唯一識別碼，如果註冊失敗，設定每1秒都會重新嘗試連線，持續連線到註冊成功為止，如果連線中斷，App還是會「持續連線」，導致連線超載，也就是該起當機事件並非駭客所為，而是App程式設計的漏洞導致。
該調查報告也指出，「並未發現任何DDoS（分散式阻斷服務攻擊）攻擊的殭屍電腦」，調查人員發現，係遠通舊有的防火牆無法負荷遠通電收eTag的App正常連線，而1月1至2日後端伺服器連線來源共有36萬5535個不同IP，其中IP來自台灣的共有36萬1247個、共連線228萬1401次，因此，每個單一IP連線次數並不多，且大部分為手機或平板電腦，「推測應為正常App連線狀況」。
政委張善政曾針對遠通電收遭駭案表示，應列資安3級「非常嚴重」等級。而行政院副院長毛治國9日在行政院會指出，遠通電收在短時間內遭到82億次攻擊，是非常惡意的行為，要求嚴辦；閣揆江宜樺則要求負責偵辦單位全力偵破攻擊來源，並請交通部加強這套電子系統的安全防護，但現在傳出遠通電收App並非遭駭，而是APP大量流量壅塞導致。