每天來回各有10個班次
瑞芳站到海科館站間，長約四．二公里，去程僅需八分鐘，回程因遇上坡，會多花上幾分鐘。復駛後預計每天來回各有十個班次，班距為六十分鐘，每天載客數可達八千五百人，單程票十五元，來回票二十八元。
瑞芳站站長黃聰賢表示，深澳支線沿途有綠蔭美景，堪稱最美的鐵路支線，該支線預計明年六月將與平溪線合併行駛，屆時菁桐站可直達海科館站。
「能夠參與這場盛事，我很高興，這是人生難得經驗。」在台鐵服務二十多年的林宛蓁，是今日首班復駛列車的車長，駕駛員則是吳德榮。
海科號APP 玩互動遊戲
海洋彩繪列車也特別設計了互動App。民眾只要下載「海科號」App後，將行動裝置對準海洋彩繪列車各車廂的固定點，行動載具就會跑出互動遊戲或是相框模式。例如，對著「深海映像號」拍照，就會跑出大海怪從車廂伸出的畫面，找朋友合照，就會拍出有大海怪做為相框的照片。
深澳支線在民國五十四年通車，本來僅具備自瑞芳站載送燃煤至深澳火力發電廠的功能，民國五十六年增加客運服務，並延長增設八斗子、深澳、瑞濱、海濱、濂洞等站，民國七十八年因為濱海公路通車而停止客運服務。
民國九十六年因應深澳發電廠關廠停止運煤，深澳支線停駛，相隔六年，再為海科館的開幕而復駛。