馬英九總統3日在調查局調查班結業典禮上致詞時，對新科調查員提出4點期許，分別是掌握兩岸情勢，維護國家安全；體察人民感受，捍衛社會正義；依法行政、保障人權；以及砥礪品德操守，貫徹慎獨、慎始、慎微。
針對近來引發爭議的監聽作為，總統強調，絕對不會違法監聽，總統說：『(原音)沒有違法，他(民眾)根本不必擔心，即使有違法，一定要涉嫌重罪，並經過檢察官申請、法院的核准核發通訊監察書，我們才能合法監聽，這些儘管都是所有執法人員都了解的道理，但民眾還是不了解。並不是沒事就監聽好玩，這是不可以的，監聽對於民眾隱私權侵害很大，一定是要到用別的方式沒有辦法達到蒐證目的時才能做。』
總統還指出，兩岸交流頻繁，來往人數眾多，調查局務必要加強反滲透、反情報工作，總統說：『(原音)這麼大的人流，中間一定會有許多涉及到國安工作的盲點、死角，必須要我們特別注意，儘管兩岸關係的和緩，是60年來最佳時刻，但我們沒有一刻能夠放鬆，因為中國大陸對台灣的基本策略沒有改變，我們一定要提高警覺。』
總統表示，反貪倡廉的重點，在於降低貪汙的犯罪率、提高定罪率，他上任以後已基本達成這個目標；而調查局是政府防腐的重要機構，期盼調查員在查案之後，仍要持續緊盯相關個案的定罪率。