交通部高速公路局說，現在行駛國道車輛，如果誤闖收費站國道電子收費ETC車道，罰金是新台幣600元到1200元。計程收費上路後，不再有人工收費，收費站將陸續拆除，已無誤闖車道問題。
另在計次階段，ETC車輛通行費逾期未繳採1站1罰，金額是300元。計程收費後，採取通行費日結歸戶，逾期未繳通行費，採1日1罰，金額也是300元。
此外，計程收費的帳單作業處理費也較省，現在計次收費，ETC車輛每16站欠費歸戶一張帳單，每張帳單加收50元。
計程收費後，每天歸戶為一筆，最多16天列在一張帳單，每張帳單也是加收50元。