國道計程收費是一種較符公平，且節能減碳的收費方式。政府原本打算自建，並分兩階段實施，先在收費站推國道電子收費（ETC）車道，再逐步走向全面計程收費。
10多年前，中華電信就接受高速公路局委託規劃ETC，並在龍潭及樹林收費站實際做測試。
不過，2002年時，立法院交通委員會將高公局編列有關ETC的預算，刪到只剩新台幣1元。在立法委員壓力下，時任交通部長林陵三決定，ETC改採BOT，交由民間興建。
ETC案有5家民間公司投標，遠通電收在激烈競爭下，取得最優申請人資格。2006年2月，首條國道ETC車道開通時，交通部長已是郭瑤琪。
不過，ETC一上路，就引來爭議。主要是要成為ETC的用戶，車上必須裝置車上機，當時遠通提供須付費的OBU，每個要新台幣1199元，消費者團體批評聲不斷。
郭瑤琪也不滿遠通的做法，要求遠通電收提公益改善方案，後來遠通不但將售價降為680元，兩年內扣款成功滿百次還可退費。
就在ETC上路才1個多月，就爆發有交通部官員涉嫌在ETC案收賄，洩漏甄審委員名單。而未得標的宇通公司向行政院公共工程委員會提出甄審不公，結果ETC上路不到半年，台北高等行政法院就撤銷遠通電收資格，並判決重新回到第二次甄審階段。
交通部為避免權益受影響，一方面先讓遠通營運，同時也進行ETC第二次甄審作業。蔡堆就是接手ETC重回二次甄審的前交通部長，因ETC給外界的印象已不佳，蔡堆只能更謹慎處理二次甄審，深怕再出問題。
ETC二次甄審結果，仍由遠通電收獲得最優資格。原本以為可以進入坦途，不過，前交部長毛治國上任後，發現ETC利用率都只有3成多，毛治國擔心國道計程目標無法達成，決定和遠通談判，要求遠通要提供免費的車上機。
遠通電收後來將車上機從OBU改為eTag，去年5月起，提供用路人免費申裝，利用率果然很快提升，如今已近90%。
葉匡時今年接任交通部長，ETC費率及橫向國道不收費問題也讓他困擾不已，原本希望實現「走多少、收多少」，但地方民意壓力太大，只好宣布橫向國道暫不收費，費率則是在多方折衝並犧牲國道基金收入下決定，預定2年後檢討。
遠通電收還因利用率問題，遭高公局認定違約，並罰4億元，協調委員會雖協調降低罰金，遠通電收無法認同，並向法院提出債權不存在訴訟。
ETC政策推動了10年，路走得坎坷，交通部及遠通電收一方面樂見終於要實現全面國道計程收費，一方面雙方還要為維護各自權益打官司。
高公局已評估，如果兩年後費率無法調整，橫向國道持續不收費，未來國道要新建交流道或其他建設，將面臨無經費的困境。這個問題會讓葉匡時或之後的交通部長繼續頭大。